A systems approach to understanding root development

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Abstract

Systems theory has been applied to process analysis in a variety of scientific disciplines from engineering to evolutionary biology. In the recent postgenomic era, the accumulation of an enormous amount of data gained from a variety of technologies has led to a revisiting of systems theory concepts. This systems biology approach has been integral in understanding a variety of processes in a number of model organisms. This review gives an overview of systems biology approaches, from component identification to modeling of networks. Various features of the root, including its development and the availability of high resolution gene expression data sets that describe root development, make the root amenable to a systems approach. The current status of systems approaches to understanding root development is reviewed.

La théorie des systèmes a été appliquée pour conduire des analyses dans une diversité de disciplines scientifiques, allant de l'ingénierie à la biologie évolutive. Dans l'ère post-génomique récente, l'accumulation d'une énorme quantité de données obtenues à l'aide d'une diversité de technologies a conduit à un retour aux concepts de la théorie des systèmes. Cette approche biologique systémique a été déterminante dans la compréhension d'une variété de processus, chez de nombreux organismes modèles. Dans leur revue, les auteurs présentent un survol des approches de la biologie systémique, allant de l'identification des composantes à la modélisation des réseaux. Différentes caractéristiques de la racine, incluant son développement et la disponibilité d'ensembles de données d'expression génétique à haute résolution, décrivant le développement racinaire, permettent de traiter la racine selon une approche systémique. Les auteurs revoient le statut actuel des approches systémiques permettant de mieux comprendre le développement racinaire.

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