Text analysis tools for identification of emerging topics and research gaps in conservation science

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Abstract

Keeping track of conceptual and methodological developments is a critical skill for research scientists, but this task is increasingly difficult due to the high rate of academic publication. As a crisis discipline, conservation science is particularly in need of tools that facilitate rapid yet insightful synthesis. We show how a common text-mining method (latent Dirichlet allocation, or topic modeling) and statistical tests familiar to ecologists (cluster analysis, regression, and network analysis) can be used to investigate trends and identify potential research gaps in the scientific literature. We tested these methods on the literature on ecological surrogates and indicators. Analysis of topic popularity within this corpus showed a strong emphasis on monitoring and management of fragmented ecosystems, while analysis of research gaps suggested a greater role for genetic surrogates and indicators. Our results show that automated text analysis methods need to be used with care, but can provide information that is complementary to that given by systematic reviews and meta-analyses, increasing scientists' capacity for research synthesis.

Herramientas de Análisis de Texto para la Identificación de Temas Emergentes y Vacíos en la Investigación de la Ciencia de la Conservación

Dar seguimiento a los desarrollos conceptuales y metodológicos es una habilidad crítica para los investigadores, pero es una tarea cada vez más difícil debido a la tasa alta de publicaciones académicas. Como una disciplina de crisis, la ciencia de la conservación está particularmente necesitada de herramientas que faciliten una síntesis rápida y a la vez profunda. Mostramos cómo un método común de búsqueda y procesamiento de textos (asignación Dirichlet latente, o modelado de temas) y las pruebas estadísticas conocidas por los ecólogos pueden ser usados para investigar tendencias e identificar vacíos potenciales de la investigación en la literatura científica. Probamos estos métodos en la literatura sobre los sustitutos y los indicadores ecológicos. El análisis de la popularidad de temas dentro de este recopilatorio mostró un fuerte énfasis en el monitoreo y manejo de los ecosistemas fragmentados, mientras que el análisis de los vacíos en la investigación sugirió un papel mayor para los sustitutos e indicadores genéticos. Nuestros resultados muestran que los métodos de análisis de texto necesitan ser usados con cuidado pero también que pueden proporcionar información que es complementaria a aquella dada por las revisiones sistemáticas y los meta-análisis, lo que incrementa la capacidad de los científicos para sintetizar la investigación.

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