A species-specific satellite DNA from the entomopathogenic nematode Heterorhabditis indicus

    loading  Checking for direct PDF access through Ovid

Abstract

An AluI satellite DNA family has been cloned from the entomopathogenic nematode Heterorhabditis indicus. This repeated sequence appears to be an unusually abundant satellite DNA, since it constitutes about 45% of the H. indicus genome. The consensus sequence is 174 nucleotides long and has an A + T content of 56%, with the presence of direct and inverted repeat clusters. DNA sequence data reveal that monomers are quite homogeneous. Such homogeneity suggests that some mechanism is acting to maintain the homogeneity of this satellite DNA, despite its abundance, or that this repeated sequence could have appeared recently in the genome of H. indicus. Hybridization analysis of genomic DNAs from different Heterorhabditis species shows that this satellite DNA sequence is specific to the H. indicus genome. Considering the species specificity and the high copy number of this AluI satellite DNA sequence, it could provide a rapid and powerful tool for identifying H. indicus strains.

Une famille d'ADN satellite AluI du nématode entomopathogène Heterorhabditis indicus a été cloné. Cette séquence répétée s'est avérée être un ADN satellite particulièrement abondant puisqu'il constitue environ 45% du génome d'H. indicus. La séquence consensus a une longueur de 174 pb et présente une richesse en AT de 56% avec des répétitions directes ou inversées. L'analyse des séquences révèle une forte homogénéité entre les monoméres. Cette homogénéité peut s'expliquer soit par l'action de certains mécanismes pour maintenir l'homogénéité de cet ADN satellite, soit par son apparition récente dans le génome d'H. indicus. Les expériences d'hybridation d'ADN génomique de différentes espèces d'Heterorhabditis montre que cette séquence d'ADN satellite est spécifique du génome d'H. indicus. Grâce à cette monospécificité et à son importante répétitivité, cette séquence d'ADN satellite pourrait représenter un outil de choix pour l'identification des souches d'H. indicus.

Related Topics

    loading  Loading Related Articles