Direct PCR-based genetic mapping of rice telomeric repeat associated sequences

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Abstract

Direct PCR-based genetic mapping of telomeric repeat associated sequences (TASs) was achieved using a RAPD primer mediated asymmetric PCR method. Twenty-two TAS loci were mapped in a rice doubled haploid population derived from a cross between an indica variety (Zhaiyeqing8) and a japonica variety (Jingxi17). Of these, 11 loci were mapped to the most distal position of seven chromosome arms and lengthened the linkage groups by 7.4–22.6 cM, five were mapped to the approximate positions of the centromeric regions, and six were mapped to other interstitial chromosomal regions.

La cartographie génétique directe des séquences associées aux répétitions télomériques (TAS) a été réalisée par amplification PCR grâce à la méthode RM-PCR («RAPD primer mediated asymmetric PCR»). Vingt-deux loci TAS ont été cartographiés chez une population d'haploïdes doublés du riz dérivées d'un croisement entre une variété indica (Zhaiyeqing8) et une variété japonica (Jingxi17). De ces loci, 11 étaient situés à l'extrémité distale de sept bras chromosomiques et ont permis d'allonger les groupes de liaison de 7,4 à 22,6 cM, cinq étaient situés à peu près au niveau des régions centromériques et six étaient localisés en d'autres régions intermédiaires.

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