Construction of a genetic linkage map and identification of AFLP markers for resistance to root-knot nematodes in peach rootstocks

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Abstract

A genetic linkage map for peach (Prunus persica(L.) Batsch) rootstocks has been constructed using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers in 55 F2 individuals derived from the cross Lovell x Nemared. From 21 different primer combinations, a total of 169 AFLP markers were scored, of which, 153 were assigned to 15 linkage groups covering 1297 centimorgans (cM) of the peach nuclear genome. The average interval between these markers was 9.1 cM. Two genes (Mi and Mij) involved in resistance to root-knot nematodes (Meloidogyne incognita (Kofoid and White) Chitwood and Meloidogyne javanica (Treub) Chitwood) were mapped to a single linkage group (Group I). These two loci were separated by a 16.5-cM interval. One codominant AFLP marker (EAA/MCAT10) was tightly linked to the Mij locus (3.4 cM), and a dominant AFLP marker (EAT/MCAT2) was found to be closely associated with the Mi locus (6.0 cM). These markers are being studied for utilization in peach rootstock breeding with marker-assisted selection.

Une carte de liaison génétique a été construite chez le Pêcher (Prunus persica(L.) Batsch) en utilisant des marqueurs AFLP (polymorphisme de longueur de fragments amplifiés) et 52 individus appartenant à une F2 dérivée d'un croisement entre les variétés Lovell et Nemared. Cent soixante-neuf marqueurs AFLP, obtenus en utilisant 21 différentes combinaisons d'amorces, ont été retenus. Parmi ces marqueurs AFLP, 153 ont été attribués à 15 groupes de liaisons couvrant ainsi 1297 centimorgans (cM) du génome nucléaire du Pêcher; résultat qui se traduit en une distance moyenne de 9.1 cM entre les marqueurs. Deux gènes (Mi et Mj) impliqués dans la résistance aux nématodes (Meloidogyne incognita (Kofoid et White) Chitwood, et Meloidogyne javanica (Treub) Chitwood) ont été cartographiés dans un seul groupe de liaison (Groupe I) et séparés par 16,5 cM. Un marqueur AFLP codominant (EAA/MCAT10) est étroitement lié au locus Mij (3,4 cM), et un marqueur AFLP dominant (EAT/MCAT2) est très proche du locus Mi (6,0 cM). Ces marqueurs sont en cours d'étude en vue de leur utilisation en sélection assistée par marqueurs (MAS) chez le Pêcher.

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