Development of STS markers closely linked to the vrs1 locus in barley, Hordeum vulgare

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Three random amplified polymorphic DNAs (RAPDs) closely linked to the vrs1 (formerly v) locus were sequenced and converted to sequence-tagged sites (STSs). Of the three STSs, two retained the RAPD polymorphism as dominant-recessive markers between ‘Kanto Nakate Gold’ (KNG; a two-rowed barley) and ‘Azumamugi’ (AZ; a six-rowed barley), while the other was co-dominant after digestion with restriction enzymes. Six restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) linked to vrs1 were converted to six STSs. All six STSs were co-dominant between the two cultivars after digestion with restriction enzymes. A reliable protocol for small-scale DNA isolation from leaf tissue was developed. The STS markers and the small-scale DNA isolation protocol developed in this study are useful tools for mapping the vrs1 locus of barley.

Trois marqueurs RAPD (ADN polymorphe amplifié au hasard) fortement liés au locus vrs1 (antérieurement connu comme le locus v) ont été séquencés et convertis en marqueurs STS («sequence-tagged sites»). Des trois STS, deux sont demeurés des marqueurs dominants de type RAPD entre les cultivars ‘Kanto Nakate Gold’ (KNG; orge à deux rangs) et ‘Azumamugi’ (AZ; orge à six rangs). Le dernier STS s'est avéré co-dominant suite à une digestion avec des enzymes de restriction. Six marqueurs RFLP (polymorphisme de longueur des fragments de restriction) liés au locus vrs1 ont été convertis en six marqueurs STS. Ces six STS constituaient des marqueurs co-dominants entre les deux cultivars suite à des digestions enzymatiques. Un protocole fiable pour l'extraction d'ADN de feuilles à petite échelle a été mis au point. Les marqueurs STS et le protocole d'extraction d'ADN à petite échelle constituent des outils utiles en vue de la cartographie du locus vrs1 chez l'orge.

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